Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trim13Q9CYB0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trim13Q9CYB0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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