Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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