Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CQC3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQC3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQC3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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