Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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