Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ssxb1Q9CPU1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ssxb1Q9CPU1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ssxb1Q9CPU1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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