Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms