Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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PtprtQ99M80 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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