Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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