Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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