Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rab28Q99KL7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rab28Q99KL7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rab28Q99KL7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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