Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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