Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Pacsin3Q99JB8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Pacsin3Q99JB8 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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