Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms