Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Med28Q920D3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms