Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms