Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms