Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vmn1r200Q8R281 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vmn1r200Q8R281 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vmn1r200Q8R281 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vmn1r200Q8R281 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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