Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms