Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Abcf3Q8K268 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Abcf3Q8K268 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Abcf3Q8K268 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Abcf3Q8K268 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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