Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms