Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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