Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms