Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms