Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Atg4aQ8C9S8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Atg4aQ8C9S8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Atg4aQ8C9S8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Atg4aQ8C9S8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Atg4aQ8C9S8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Atg4aQ8C9S8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Atg4aQ8C9S8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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