Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vwc2Q8C8N3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vwc2Q8C8N3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms