Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Col6a6Q8C6K9 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Col6a6Q8C6K9 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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