Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TdrpQ8C5P7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms