Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx17Q8BVL3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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