Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp54Q8BL06 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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Usp54Q8BL06 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms