Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca8Q8BHX3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms