Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pcsk9Q80W65 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcsk9Q80W65 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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