Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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