Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Dbt-201ENSMUST00000000349 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 AC166902.3-201ENSMUST00000216696 991 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms