Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms