Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Uhrf2Q7TMI3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms