Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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