Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmeff1Q6PFE7 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmeff1Q6PFE7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmeff1Q6PFE7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms