Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rad54bQ6PFE3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rad54bQ6PFE3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rad54bQ6PFE3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rad54bQ6PFE3 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rad54bQ6PFE3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rad54bQ6PFE3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rad54bQ6PFE3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rad54bQ6PFE3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rad54bQ6PFE3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rad54bQ6PFE3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rad54bQ6PFE3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rad54bQ6PFE3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rad54bQ6PFE3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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