Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2aQ6P4T0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms