Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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