Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pkp4Q68FH0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pkp4Q68FH0 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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