Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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AtmQ62388 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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AtmQ62388 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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AtmQ62388 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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AtmQ62388 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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AtmQ62388 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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