Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Taf6Q62311 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms