Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Cd47Q61735 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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