Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms