Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms