Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Vmn1r223Q5SSA0 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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