Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mdc1Q5PSV9 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mdc1Q5PSV9 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Mdc1Q5PSV9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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Mdc1Q5PSV9 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mdc1Q5PSV9 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mdc1Q5PSV9 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mdc1Q5PSV9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mdc1Q5PSV9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mdc1Q5PSV9 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mdc1Q5PSV9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mdc1Q5PSV9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mdc1Q5PSV9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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