Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim58Q5NCC9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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