Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ecm2Q5FW85 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms